气相色谱仪噪声滤除主要是指滤除谱图中的高频噪声。谱峰识别是从与谱峰宽度水平适当的曲线变化中将实在信号峰与同频噪声区别开来，扫除伪峰。气相色谱仪基线校对是校对基线漂移、歪曲等低频噪声的影响。

气相色谱仪色谱采样数据中并不单纯是所期望的物质呼应信号，它还叠加了整个剖析体系发生的噪声。其中的高频噪声多归于采样、改换等设备中的电噪声，在图形上表现为谱图曲线上的“毛刺”。在对气相色谱仪谱图数据进行处理的步就是去除数据中的高频噪声，改善信噪比，为后续的数据处理工作奠定一个杰出的基础。根据信号和噪声之间的差异，用程序对数字信号进行滑润处理，称为软件滤液。